День налогового работника Кыргызстана установлен Постановлением Правительства Кыргызской Республики № 262 от 12 апреля 2006 года, учитывая значительный вклад работников налоговой службы в социально-экономическое развитие республики и в целях обеспечения преемственности традиций налоговой службы Кыргызской Республики.

Налоговая служба Кыргызстана была создана в 1990 году на базе высшего управления госдоходами Министерства финансов. Указом Президента Кыргызской Республики от 14 апреля 2005 года Государственная налоговая инспекция была переведена в непосредственное подчинение Правительства Кыргызской Республики.

В соответствии с Законом Кыргызской Республики "О структуре Правительства Кыргызской Республики" № 12 от 6 февраля 2007 года на базе Государственной налоговой инспекции при Правительстве был образован Государственный комитет КР по налогам и сборам.