Иоганн Кристоф Глаубиц родился не позднее 1737 года. Точная дата рождения неизвестна. Вероятно, он родился в Силезии, хотя высказывались предположения о том, что он был уроженцем Вильны. Судя по формам и орнаменту его ранних произведений, напоминающих раннее немецкое рококо, архитектуру изучал в Южной Германии.

Опустошительные пожары 1737, 1748 и 1749 годов нанесли глубокие повреждения кварталам Старого города Вильны. Глаубиц участвовал в работах по восстановлению, реконструкции и строительстве ансамблей и отдельных зданий.

До 1737 года Глаубиц был членом совета и архитектором общины евангеликов-лютеран. В 1737-1744 годах он отстроил и реконструировал в формах позднего барокко храм евангеликов-лютеран и прилегающие здания общины. По его проекту и при его участии в 1741-1742 годах в храме был сооружён пышный барочный алтарь.

По его проектам в Вильне построены или реконструированы храмы различных конфессий.

По проектам Глаубица реконструировались жилые дома в Литве, строились дворцы и костёлы в Белоруссии.

В 1748-1765 годах Глаубиц работал над реконструкцией базилианского кафедрального собора Святой Софии в Полоцке; вероятно, самое высокое и самое внушительное по своим размерам барочное строение в Белоруссии.

К число главных его работ относится также костёл кармелиток в Глубоком. В 1748-1749 он спроектировал и построил двухэтажный дворец униатского митрополита Гребницкого в Струне под Полоцком. По его проекту построен трёхнефный костёл Воздвижения Святого Креста в Лиде.

Его постройкам свойственны оригинальные черты виленского барокко, отличающегося изящностью форм и декоративностью. Яркая особенность созданного Глаубицем стиля – две, как правило, высокие и лёгкие башни главного фасада с ярусами, по-разному украшенными.

Архитектор скончался 30 марта 1767 года в Вильно.